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簡要描述:產(chǎn)品名稱:illumina授權(quán)代理商 文庫制備試劑盒A 產(chǎn)品貨號:IP-202-1012產(chǎn)品說明:illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒用于Chlp來源DNA的染色質(zhì)免疫沉淀測序文庫制備。大約1.5天完成5ng DNA文庫的制備。
品牌 | illumina/美國因美納 | 供貨周期 | 現(xiàn)貨 |
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應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè) |
產(chǎn)品名稱:illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set A
產(chǎn)品貨號:IP-202-1012
產(chǎn)品說明:
測定時間 從芯片DNA到1.5天
輸入量 5 ng芯片dna
系統(tǒng)兼容性 HiSeq 1000,HiSeq 1500,HiSeq 2000HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, 米塞克, 研究模式下的MiSeqDx, NextSeq 500, NextSeq 550
特殊樣本類型 低輸入樣本
物種類別 酵母,老鼠,果蠅,人,斑馬魚,細(xì)菌,線蟲,任何物種,老鼠,植物
技術(shù) 測序
方法 切克
核酸型 脫氧核糖核酸
產(chǎn)品介紹:
illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒用于Chlp來源DNA的染色質(zhì)免疫沉淀測序文庫制備。大約1.5天完成5ng DNA文庫的制備。TruSeq芯片Libary準(zhǔn)備試劑盒為從芯片衍生DNA生成染色質(zhì)免疫沉淀測序(芯片-Seq)庫提供了一種簡單、成本效益高的解決方案。芯片-seq利用下一代測序(NGS)快速而有效地確定基因組中所關(guān)注的dna結(jié)合蛋白的分布和豐度。這種方法已成為zui廣泛應(yīng)用的NGS應(yīng)用之一,使研究人員能夠可靠地同時識別整個基因組中廣泛目標(biāo)的結(jié)合位點(diǎn),具有高分辨率和無約束。
產(chǎn)品名稱:illumina授權(quán)代理商 文庫制備試劑盒A 產(chǎn)品貨號:IP-202-1012
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illumina代理商:重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司
熱賣產(chǎn)品:
品牌 產(chǎn)品貨號 產(chǎn)品名稱
illumina IP-202-1012 illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set A
illumina IP-202-1024 illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set B
產(chǎn)品名稱:illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set A
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illumina代理商:重慶市華雅干細(xì)胞技術(shù)有限公司
Illumina二代測序技術(shù),邊合成邊測序(SBS),是廣泛采用的新一代測序(NGS)技術(shù),負(fù)責(zé)產(chǎn)生世界上90%以上的測序數(shù)據(jù)。
Illumina的二代測序技術(shù)稱為邊合成邊測序(Sequencing-by-Synthesis,簡稱SBS)。SBS主要包括堿基延伸、熒光激發(fā)及信號收集、剪切等3個步驟。這3個步驟可以重復(fù),循環(huán)進(jìn)行。每循環(huán)一次測定一個堿基。想測定多少個堿基(即讀長),就循環(huán)多少次。測序循環(huán)次數(shù)可以在軟件里設(shè)定。到底測序多長合適,要根據(jù)項(xiàng)目性質(zhì)和需求來決定。大多數(shù)情況下,SR實(shí)驗(yàn)(單端測序)測定1x50個堿基,PE實(shí)驗(yàn)(雙端測序)測定2x150個堿基。
1 堿基延伸
Illumina測序試劑里所使用的dNTP極ju特色,它們同時具有兩個修飾基團(tuán):一個熒光基團(tuán),一個可逆終止基團(tuán)。A、G、C、T 4種堿基分別標(biāo)記4種不同的熒光基團(tuán),它們在不同波長的激光激發(fā)下,能夠發(fā)射不同波長(即顏色)的熒光。熒光顏色與堿基種類一一對應(yīng),因此根據(jù)激發(fā)光的波長可以識別堿基。4種堿基的終止基團(tuán)是一樣的。由于終止基團(tuán)的存在,所有dNTP每次都只能延伸1個堿基,無論給予多長的反應(yīng)時間。又由于該終止基團(tuán)是可逆的,在熒光信號收集完畢之后,可以用剪切劑切除該終止基團(tuán),使堿基恢復(fù)自然的可延伸狀態(tài),這時即可繼續(xù)進(jìn)行下一輪循環(huán),再測定一個堿基。
可逆終止基團(tuán)技術(shù)是Illumina二代測序的一大特色。它與橋式PCR技術(shù)一起,構(gòu)成了Illumina二代測序的兩大支柱,為穩(wěn)定獲得高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)打下了堅實(shí)的基礎(chǔ)。
2 信號采集
HiSeq系列測序儀具有紅綠兩根激光管,兩個濾色片。它們兩兩組合,可以形成4種不同的激發(fā)波長,正好分別用于激發(fā)A、G、C、T 4種堿基。
Cluster上所標(biāo)記的熒光基團(tuán)在激光激發(fā)下產(chǎn)生的信號,可以用相機(jī)拍攝或者掃描的方式收集信號。掃描技術(shù)速度比較快,被X10系列采用。由于FC面積比較大,而且上表面和下表面要分別拍照,所以拍照過程相當(dāng)耗時。對于經(jīng)典的HiSeq 2000來說,一次測序循環(huán)所產(chǎn)生的熒光信號,需要大約40分鐘的時間才能拍照收集完畢,時間比測序反應(yīng)本身還要長。
3 剪切
熒光信號收集完畢后,關(guān)閉激光,用剪切劑去除測序引物的延伸產(chǎn)物上的堿基所標(biāo)記的熒光基團(tuán)和終止基團(tuán)。兩個修飾基團(tuán)均被切除,一方面消去干擾熒光,一方面使鏈末端的堿基回復(fù)到自然的可延伸狀態(tài),為下一輪測序做好準(zhǔn)備。
再重復(fù)合成、激發(fā)、收集等步驟,即可進(jìn)行第二個堿基的測序。
測序循環(huán)可以重復(fù)多次。理論上可以一直重復(fù),直到信噪比降低得無法有效識別堿基信號為止。由于熒光基團(tuán)的發(fā)光效率持續(xù)不斷在衰減,Taq酶的活性也在持續(xù)不斷地衰減,所以實(shí)際上測序循環(huán)次數(shù)是有限的,大重復(fù)次數(shù)與sbs試劑的配方有關(guān)。測序的循環(huán)次數(shù)可以在軟件設(shè)置過程中人為,這個重復(fù)次數(shù)就是每個測序片段的讀長。目前,Illumina平臺的讀長有2x100 bp,2x125 bp,2x150 bp,2x300 bp等多種,其中2x150 bp用得zui廣泛。
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